近年来，随着旅游业的迅猛发展，乌云界国家级自然保护区也进行了适度旅游开发，开展了形式多样的生态旅游活动，为自然保护区的发展带来了生机与活力，并取得了一定的成效。实践证明，在乌云界自然保护区开展生态旅游对保护区自身的建设及当地旅游业的发展都极为有利。但同时我们也应看到在保护区内开展生态旅游还存在一定的问题，如何处理保护与开发的问题？如何在保护区内开展生态旅游以做到可持续发展？乌云界国家级自然保护区有自己的答案。

自然保护区是保护自然景观的整个生态系统，它也保护着生物多样性，但其目的不应仅仅是保护，更应包括观察和研究的内容。保护与开发一直是保护区旅游业发展的核心问题，如何合理处理保护与开发的关系，有效的发展生态旅游，是大多数保护区一直困扰的焦点。作为一个建立时间很短，资源条件不是很好的自然保护区，我们一直坚持以本土景观特色，现代生态科技，华夏文化思想和东方哲学理念，构筑具有乌云界特色的生态文明旅游。因此我们除了保护，还非常注重自然保护区生态旅游开发中应遵循的保护与开发并重、三大效益组合最佳、统一规划、合理布局、重点开发、协调发展等原则，研究和制定出乌云界自然保护区生态旅游总体规划并获得批准，建立了花源里生态旅游示范区，进行合理分区，合理规划生态旅游景区，协调生态旅游自然环境保护与社区发展的旅游行为。

在保护区的生态旅游发展可持续上，我们根据乌云界自然保护区的保护类型，长期邀请湖南农大、湖南师大、吉首大学、北京林大等国内知名院校的教授和专家来保护区，在规划旅游开发的区域开展动植物科考调研，对珍稀保护植物进行挂牌保护，对珍稀保护动物，规划旅游线路的上考虑给它们留下一些生存、发展、繁殖的空间，给它们留一块栖息地，提升生态旅游开发的科技含量，最大限度避免在珍稀植物、珍稀鸟类、珍稀兽类活动区域开展旅游开发活动。

在保护区的生态旅游产品开发中，我们正试图将生态环境、生态景观、生态科技、生态文化、生态商品、生态产业，以至生态服务等都做成生态旅游产品。将生态旅游资源和生态产品专业化、多样化和经营管理、服务、消费等的生态化和人性化理念融入乌云界生态旅游开发中，以大生态的理念发展生态旅游，实现乌云界自然保护区的全面可持续发展。